Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTA3P0C7M3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms