Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXB7P09629 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
HOXB7P09629 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
HOXB7P09629 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXB7P09629 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXB7P09629 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXB7P09629 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXB7P09629 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXB7P09629 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXB7P09629 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXB7P09629 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXB7P09629 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXB7P09629 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXB7P09629 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HOXB7P09629 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HOXB7P09629 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HOXB7P09629 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HOXB7P09629 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
HOXB7P09629 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HOXB7P09629 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HOXB7P09629 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXB7P09629 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HOXB7P09629 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXB7P09629 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HOXB7P09629 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOXB7P09629 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOXB7P09629 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOXB7P09629 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOXB7P09629 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HOXB7P09629 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOXB7P09629 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HOXB7P09629 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HOXB7P09629 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HOXB7P09629 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXB7P09629 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXB7P09629 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOXB7P09629 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOXB7P09629 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXB7P09629 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOXB7P09629 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXB7P09629 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXB7P09629 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HOXB7P09629 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOXB7P09629 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXB7P09629 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXB7P09629 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOXB7P09629 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXB7P09629 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOXB7P09629 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXB7P09629 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOXB7P09629 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXB7P09629 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOXB7P09629 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXB7P09629 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HOXB7P09629 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXB7P09629 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOXB7P09629 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOXB7P09629 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXB7P09629 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOXB7P09629 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOXB7P09629 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXB7P09629 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
HOXB7P09629 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
HOXB7P09629 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXB7P09629 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms