Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPBP07199 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPBP07199 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPBP07199 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPBP07199 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPBP07199 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPBP07199 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPBP07199 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CENPBP07199 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CENPBP07199 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CENPBP07199 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CENPBP07199 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CENPBP07199 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CENPBP07199 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CENPBP07199 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CENPBP07199 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CENPBP07199 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CENPBP07199 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CENPBP07199 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CENPBP07199 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CENPBP07199 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CENPBP07199 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CENPBP07199 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CENPBP07199 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CENPBP07199 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CENPBP07199 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CENPBP07199 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CENPBP07199 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CENPBP07199 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CENPBP07199 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CENPBP07199 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CENPBP07199 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CENPBP07199 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CENPBP07199 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CENPBP07199 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CENPBP07199 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CENPBP07199 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CENPBP07199 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CENPBP07199 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CENPBP07199 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CENPBP07199 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CENPBP07199 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CENPBP07199 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CENPBP07199 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CENPBP07199 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CENPBP07199 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CENPBP07199 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CENPBP07199 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CENPBP07199 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CENPBP07199 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CENPBP07199 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CENPBP07199 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CENPBP07199 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CENPBP07199 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CENPBP07199 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CENPBP07199 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPBP07199 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPBP07199 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPBP07199 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPBP07199 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPBP07199 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPBP07199 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPBP07199 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPBP07199 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPBP07199 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPBP07199 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPBP07199 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPBP07199 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CENPBP07199 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CENPBP07199 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CENPBP07199 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CENPBP07199 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CENPBP07199 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CENPBP07199 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CENPBP07199 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CENPBP07199 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CENPBP07199 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CENPBP07199 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CENPBP07199 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CENPBP07199 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CENPBP07199 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CENPBP07199 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CENPBP07199 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CENPBP07199 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CENPBP07199 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPBP07199 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPBP07199 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPBP07199 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPBP07199 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPBP07199 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPBP07199 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPBP07199 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPBP07199 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPBP07199 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPBP07199 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPBP07199 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPBP07199 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPBP07199 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CENPBP07199 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CENPBP07199 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms