Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA4P06727 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA4P06727 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA4P06727 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA4P06727 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA4P06727 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA4P06727 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA4P06727 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA4P06727 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA4P06727 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA4P06727 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA4P06727 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA4P06727 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA4P06727 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA4P06727 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA4P06727 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA4P06727 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA4P06727 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA4P06727 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA4P06727 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA4P06727 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA4P06727 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA4P06727 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA4P06727 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA4P06727 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA4P06727 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA4P06727 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA4P06727 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA4P06727 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA4P06727 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA4P06727 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA4P06727 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA4P06727 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA4P06727 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA4P06727 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA4P06727 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA4P06727 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA4P06727 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA4P06727 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA4P06727 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA4P06727 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA4P06727 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA4P06727 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA4P06727 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA4P06727 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA4P06727 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA4P06727 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA4P06727 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA4P06727 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA4P06727 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA4P06727 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA4P06727 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA4P06727 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA4P06727 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA4P06727 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA4P06727 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA4P06727 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA4P06727 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA4P06727 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA4P06727 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA4P06727 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA4P06727 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
APOA4P06727 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
APOA4P06727 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA4P06727 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA4P06727 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA4P06727 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA4P06727 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA4P06727 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA4P06727 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA4P06727 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA4P06727 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA4P06727 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA4P06727 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA4P06727 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA4P06727 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA4P06727 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA4P06727 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA4P06727 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA4P06727 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA4P06727 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA4P06727 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA4P06727 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA4P06727 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA4P06727 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA4P06727 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA4P06727 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA4P06727 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA4P06727 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA4P06727 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA4P06727 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA4P06727 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA4P06727 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA4P06727 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA4P06727 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA4P06727 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA4P06727 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA4P06727 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA4P06727 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA4P06727 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms