Protein–RNA interactions for Protein: P02771

AFP, Alpha-fetoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFPP02771 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
AFPP02771 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFPP02771 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFPP02771 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFPP02771 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
AFPP02771 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFPP02771 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFPP02771 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFPP02771 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFPP02771 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFPP02771 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFPP02771 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFPP02771 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFPP02771 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFPP02771 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AFPP02771 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AFPP02771 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AFPP02771 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AFPP02771 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AFPP02771 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AFPP02771 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFPP02771 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFPP02771 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFPP02771 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFPP02771 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFPP02771 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFPP02771 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFPP02771 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFPP02771 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFPP02771 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AFPP02771 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFPP02771 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AFPP02771 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AFPP02771 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AFPP02771 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AFPP02771 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AFPP02771 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AFPP02771 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AFPP02771 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AFPP02771 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AFPP02771 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AFPP02771 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AFPP02771 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AFPP02771 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AFPP02771 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AFPP02771 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFPP02771 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFPP02771 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFPP02771 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFPP02771 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFPP02771 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFPP02771 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AFPP02771 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFPP02771 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFPP02771 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AFPP02771 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFPP02771 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFPP02771 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFPP02771 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFPP02771 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFPP02771 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFPP02771 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFPP02771 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AFPP02771 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFPP02771 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFPP02771 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFPP02771 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFPP02771 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFPP02771 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFPP02771 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AFPP02771 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFPP02771 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
AFPP02771 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFPP02771 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFPP02771 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFPP02771 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFPP02771 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFPP02771 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFPP02771 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFPP02771 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFPP02771 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFPP02771 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFPP02771 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFPP02771 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
AFPP02771 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFPP02771 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFPP02771 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFPP02771 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFPP02771 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFPP02771 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFPP02771 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFPP02771 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AFPP02771 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFPP02771 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFPP02771 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFPP02771 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFPP02771 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFPP02771 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFPP02771 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AFPP02771 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms