Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NSD2O96028 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NSD2O96028 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NSD2O96028 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NSD2O96028 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NSD2O96028 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NSD2O96028 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NSD2O96028 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NSD2O96028 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NSD2O96028 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NSD2O96028 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NSD2O96028 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NSD2O96028 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NSD2O96028 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NSD2O96028 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NSD2O96028 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NSD2O96028 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NSD2O96028 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NSD2O96028 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NSD2O96028 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NSD2O96028 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NSD2O96028 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NSD2O96028 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NSD2O96028 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NSD2O96028 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NSD2O96028 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NSD2O96028 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NSD2O96028 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NSD2O96028 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NSD2O96028 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NSD2O96028 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NSD2O96028 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NSD2O96028 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NSD2O96028 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NSD2O96028 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NSD2O96028 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NSD2O96028 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NSD2O96028 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NSD2O96028 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NSD2O96028 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NSD2O96028 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NSD2O96028 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NSD2O96028 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NSD2O96028 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NSD2O96028 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NSD2O96028 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NSD2O96028 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NSD2O96028 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NSD2O96028 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NSD2O96028 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NSD2O96028 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NSD2O96028 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NSD2O96028 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NSD2O96028 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NSD2O96028 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NSD2O96028 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NSD2O96028 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NSD2O96028 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NSD2O96028 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NSD2O96028 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NSD2O96028 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NSD2O96028 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NSD2O96028 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NSD2O96028 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NSD2O96028 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NSD2O96028 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NSD2O96028 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NSD2O96028 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NSD2O96028 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NSD2O96028 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NSD2O96028 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NSD2O96028 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NSD2O96028 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NSD2O96028 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NSD2O96028 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NSD2O96028 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NSD2O96028 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NSD2O96028 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NSD2O96028 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NSD2O96028 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NSD2O96028 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NSD2O96028 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NSD2O96028 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NSD2O96028 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NSD2O96028 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NSD2O96028 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NSD2O96028 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NSD2O96028 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NSD2O96028 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NSD2O96028 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NSD2O96028 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NSD2O96028 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NSD2O96028 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NSD2O96028 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NSD2O96028 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NSD2O96028 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NSD2O96028 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NSD2O96028 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NSD2O96028 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NSD2O96028 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms