Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRUB2O95900 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRUB2O95900 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms