Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAP29O95721 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms