Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX6O95475 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX6O95475 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIX6O95475 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIX6O95475 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX6O95475 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX6O95475 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX6O95475 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX6O95475 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX6O95475 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX6O95475 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX6O95475 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX6O95475 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX6O95475 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX6O95475 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX6O95475 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX6O95475 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX6O95475 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX6O95475 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX6O95475 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX6O95475 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX6O95475 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIX6O95475 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX6O95475 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX6O95475 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX6O95475 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX6O95475 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX6O95475 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX6O95475 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX6O95475 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX6O95475 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX6O95475 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX6O95475 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX6O95475 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX6O95475 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX6O95475 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX6O95475 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX6O95475 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX6O95475 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX6O95475 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX6O95475 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX6O95475 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX6O95475 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX6O95475 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX6O95475 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX6O95475 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX6O95475 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX6O95475 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX6O95475 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX6O95475 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX6O95475 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIX6O95475 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX6O95475 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX6O95475 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX6O95475 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX6O95475 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX6O95475 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX6O95475 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX6O95475 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX6O95475 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX6O95475 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX6O95475 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX6O95475 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX6O95475 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX6O95475 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX6O95475 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX6O95475 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX6O95475 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX6O95475 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX6O95475 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX6O95475 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIX6O95475 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX6O95475 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX6O95475 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX6O95475 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX6O95475 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX6O95475 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX6O95475 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX6O95475 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX6O95475 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX6O95475 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX6O95475 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX6O95475 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX6O95475 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX6O95475 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX6O95475 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX6O95475 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX6O95475 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX6O95475 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX6O95475 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX6O95475 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX6O95475 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX6O95475 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIX6O95475 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SIX6O95475 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX6O95475 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX6O95475 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX6O95475 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX6O95475 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX6O95475 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms