Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LCA5LO95447 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCA5LO95447 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms