Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB5O95377 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB5O95377 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB5O95377 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB5O95377 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB5O95377 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB5O95377 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB5O95377 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB5O95377 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB5O95377 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB5O95377 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB5O95377 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB5O95377 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB5O95377 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB5O95377 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB5O95377 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB5O95377 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB5O95377 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB5O95377 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB5O95377 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB5O95377 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB5O95377 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB5O95377 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB5O95377 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB5O95377 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB5O95377 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB5O95377 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB5O95377 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB5O95377 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB5O95377 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB5O95377 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB5O95377 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB5O95377 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB5O95377 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB5O95377 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB5O95377 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB5O95377 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB5O95377 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB5O95377 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB5O95377 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB5O95377 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB5O95377 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB5O95377 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB5O95377 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB5O95377 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB5O95377 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB5O95377 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB5O95377 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB5O95377 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB5O95377 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB5O95377 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB5O95377 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB5O95377 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB5O95377 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB5O95377 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB5O95377 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB5O95377 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB5O95377 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB5O95377 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB5O95377 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB5O95377 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB5O95377 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB5O95377 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB5O95377 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB5O95377 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB5O95377 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB5O95377 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB5O95377 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB5O95377 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB5O95377 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB5O95377 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB5O95377 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB5O95377 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB5O95377 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB5O95377 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB5O95377 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB5O95377 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB5O95377 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB5O95377 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB5O95377 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB5O95377 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB5O95377 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB5O95377 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB5O95377 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB5O95377 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB5O95377 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB5O95377 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB5O95377 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB5O95377 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB5O95377 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB5O95377 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB5O95377 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB5O95377 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB5O95377 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB5O95377 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB5O95377 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB5O95377 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB5O95377 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB5O95377 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB5O95377 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms