Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD4O95243 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD4O95243 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD4O95243 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD4O95243 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD4O95243 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD4O95243 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD4O95243 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD4O95243 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD4O95243 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD4O95243 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD4O95243 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD4O95243 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD4O95243 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD4O95243 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD4O95243 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD4O95243 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD4O95243 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD4O95243 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD4O95243 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD4O95243 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD4O95243 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD4O95243 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD4O95243 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD4O95243 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD4O95243 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD4O95243 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD4O95243 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD4O95243 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD4O95243 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD4O95243 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD4O95243 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD4O95243 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD4O95243 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD4O95243 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD4O95243 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD4O95243 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD4O95243 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD4O95243 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD4O95243 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD4O95243 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD4O95243 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD4O95243 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD4O95243 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD4O95243 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD4O95243 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD4O95243 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD4O95243 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD4O95243 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD4O95243 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD4O95243 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD4O95243 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD4O95243 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD4O95243 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD4O95243 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD4O95243 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD4O95243 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD4O95243 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD4O95243 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD4O95243 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD4O95243 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD4O95243 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD4O95243 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD4O95243 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD4O95243 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD4O95243 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD4O95243 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD4O95243 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD4O95243 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD4O95243 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD4O95243 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD4O95243 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD4O95243 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD4O95243 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD4O95243 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD4O95243 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD4O95243 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD4O95243 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD4O95243 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD4O95243 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD4O95243 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD4O95243 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD4O95243 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD4O95243 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD4O95243 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD4O95243 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD4O95243 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD4O95243 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD4O95243 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD4O95243 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD4O95243 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD4O95243 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD4O95243 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD4O95243 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD4O95243 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD4O95243 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD4O95243 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD4O95243 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD4O95243 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD4O95243 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms