Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX4O95219 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX4O95219 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX4O95219 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX4O95219 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX4O95219 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX4O95219 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX4O95219 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX4O95219 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX4O95219 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX4O95219 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX4O95219 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX4O95219 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX4O95219 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX4O95219 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX4O95219 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX4O95219 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX4O95219 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX4O95219 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX4O95219 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX4O95219 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX4O95219 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX4O95219 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX4O95219 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX4O95219 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX4O95219 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX4O95219 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX4O95219 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX4O95219 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX4O95219 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX4O95219 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX4O95219 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX4O95219 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX4O95219 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX4O95219 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX4O95219 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX4O95219 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX4O95219 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX4O95219 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX4O95219 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX4O95219 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX4O95219 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX4O95219 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX4O95219 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX4O95219 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX4O95219 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX4O95219 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX4O95219 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX4O95219 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX4O95219 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX4O95219 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX4O95219 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX4O95219 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX4O95219 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX4O95219 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX4O95219 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX4O95219 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX4O95219 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX4O95219 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX4O95219 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX4O95219 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX4O95219 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX4O95219 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX4O95219 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX4O95219 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX4O95219 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX4O95219 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX4O95219 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX4O95219 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX4O95219 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX4O95219 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX4O95219 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX4O95219 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX4O95219 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX4O95219 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX4O95219 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX4O95219 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX4O95219 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX4O95219 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX4O95219 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX4O95219 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX4O95219 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX4O95219 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX4O95219 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX4O95219 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX4O95219 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX4O95219 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX4O95219 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX4O95219 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX4O95219 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX4O95219 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX4O95219 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX4O95219 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX4O95219 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX4O95219 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX4O95219 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX4O95219 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX4O95219 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX4O95219 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX4O95219 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms