Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRIG2O94898 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms