Protein–RNA interactions for Protein: O75818

RPP40, Ribonuclease P protein subunit p40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPP40O75818 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPP40O75818 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPP40O75818 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPP40O75818 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPP40O75818 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPP40O75818 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPP40O75818 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPP40O75818 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPP40O75818 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPP40O75818 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPP40O75818 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPP40O75818 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPP40O75818 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPP40O75818 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPP40O75818 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPP40O75818 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPP40O75818 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPP40O75818 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPP40O75818 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPP40O75818 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPP40O75818 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPP40O75818 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPP40O75818 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPP40O75818 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPP40O75818 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPP40O75818 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPP40O75818 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPP40O75818 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPP40O75818 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPP40O75818 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPP40O75818 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPP40O75818 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPP40O75818 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPP40O75818 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPP40O75818 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPP40O75818 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPP40O75818 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPP40O75818 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPP40O75818 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPP40O75818 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPP40O75818 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPP40O75818 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPP40O75818 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPP40O75818 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPP40O75818 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPP40O75818 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPP40O75818 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPP40O75818 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPP40O75818 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPP40O75818 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPP40O75818 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPP40O75818 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPP40O75818 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPP40O75818 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPP40O75818 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPP40O75818 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPP40O75818 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPP40O75818 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPP40O75818 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPP40O75818 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPP40O75818 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPP40O75818 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPP40O75818 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPP40O75818 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPP40O75818 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPP40O75818 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPP40O75818 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPP40O75818 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPP40O75818 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPP40O75818 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPP40O75818 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPP40O75818 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPP40O75818 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPP40O75818 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPP40O75818 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPP40O75818 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPP40O75818 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPP40O75818 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPP40O75818 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPP40O75818 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPP40O75818 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPP40O75818 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPP40O75818 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPP40O75818 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPP40O75818 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPP40O75818 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPP40O75818 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPP40O75818 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPP40O75818 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPP40O75818 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPP40O75818 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPP40O75818 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPP40O75818 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPP40O75818 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPP40O75818 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPP40O75818 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPP40O75818 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPP40O75818 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPP40O75818 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPP40O75818 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms