Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP3LO60238 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNIP3LO60238 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms