Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTRA2O43464 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms