Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSI1O43347 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSI1O43347 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSI1O43347 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSI1O43347 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSI1O43347 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSI1O43347 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSI1O43347 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MSI1O43347 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSI1O43347 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSI1O43347 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSI1O43347 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSI1O43347 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSI1O43347 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSI1O43347 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSI1O43347 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSI1O43347 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSI1O43347 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSI1O43347 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSI1O43347 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSI1O43347 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSI1O43347 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSI1O43347 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSI1O43347 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSI1O43347 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSI1O43347 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSI1O43347 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSI1O43347 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSI1O43347 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSI1O43347 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSI1O43347 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSI1O43347 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSI1O43347 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSI1O43347 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSI1O43347 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSI1O43347 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSI1O43347 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSI1O43347 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MSI1O43347 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MSI1O43347 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MSI1O43347 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSI1O43347 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSI1O43347 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSI1O43347 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSI1O43347 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSI1O43347 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSI1O43347 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSI1O43347 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSI1O43347 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSI1O43347 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSI1O43347 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSI1O43347 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSI1O43347 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSI1O43347 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MSI1O43347 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSI1O43347 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSI1O43347 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSI1O43347 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSI1O43347 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSI1O43347 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSI1O43347 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSI1O43347 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSI1O43347 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSI1O43347 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSI1O43347 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSI1O43347 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSI1O43347 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSI1O43347 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSI1O43347 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSI1O43347 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSI1O43347 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSI1O43347 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSI1O43347 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSI1O43347 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSI1O43347 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSI1O43347 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MSI1O43347 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSI1O43347 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSI1O43347 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSI1O43347 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSI1O43347 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSI1O43347 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSI1O43347 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSI1O43347 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSI1O43347 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSI1O43347 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSI1O43347 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSI1O43347 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MSI1O43347 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSI1O43347 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSI1O43347 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSI1O43347 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSI1O43347 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSI1O43347 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSI1O43347 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSI1O43347 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MSI1O43347 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSI1O43347 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSI1O43347 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSI1O43347 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms