Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLGNO14967 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLGNO14967 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLGNO14967 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLGNO14967 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLGNO14967 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLGNO14967 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLGNO14967 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLGNO14967 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLGNO14967 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLGNO14967 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLGNO14967 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLGNO14967 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLGNO14967 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLGNO14967 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLGNO14967 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLGNO14967 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLGNO14967 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLGNO14967 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLGNO14967 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLGNO14967 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLGNO14967 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLGNO14967 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLGNO14967 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLGNO14967 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLGNO14967 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLGNO14967 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLGNO14967 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLGNO14967 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLGNO14967 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLGNO14967 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLGNO14967 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLGNO14967 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLGNO14967 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLGNO14967 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLGNO14967 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLGNO14967 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLGNO14967 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLGNO14967 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLGNO14967 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLGNO14967 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLGNO14967 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLGNO14967 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLGNO14967 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLGNO14967 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLGNO14967 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLGNO14967 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLGNO14967 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLGNO14967 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLGNO14967 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLGNO14967 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLGNO14967 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLGNO14967 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLGNO14967 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLGNO14967 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLGNO14967 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLGNO14967 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLGNO14967 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLGNO14967 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLGNO14967 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLGNO14967 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLGNO14967 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLGNO14967 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLGNO14967 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLGNO14967 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLGNO14967 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLGNO14967 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLGNO14967 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLGNO14967 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLGNO14967 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLGNO14967 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLGNO14967 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLGNO14967 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLGNO14967 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLGNO14967 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLGNO14967 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLGNO14967 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLGNO14967 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLGNO14967 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLGNO14967 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CLGNO14967 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLGNO14967 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLGNO14967 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLGNO14967 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLGNO14967 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLGNO14967 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLGNO14967 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLGNO14967 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLGNO14967 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLGNO14967 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLGNO14967 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLGNO14967 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLGNO14967 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLGNO14967 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLGNO14967 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CLGNO14967 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLGNO14967 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLGNO14967 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLGNO14967 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLGNO14967 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms