Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
J3KR12 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
J3KR12 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
J3KR12 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
J3KR12 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22■■□□□ 1.11
J3KR12 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
J3KR12 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
J3KR12 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3KR12 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3KR12 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
J3KR12 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3KR12 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3KR12 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3KR12 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3KR12 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3KR12 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3KR12 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3KR12 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3KR12 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3KR12 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3KR12 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3KR12 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3KR12 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3KR12 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3KR12 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3KR12 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3KR12 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3KR12 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3KR12 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3KR12 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
J3KR12 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3KR12 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3KR12 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3KR12 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3KR12 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3KR12 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3KR12 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3KR12 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3KR12 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3KR12 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3KR12 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
J3KR12 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3KR12 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3KR12 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3KR12 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3KR12 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3KR12 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3KR12 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3KR12 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3KR12 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3KR12 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3KR12 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3KR12 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3KR12 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3KR12 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3KR12 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3KR12 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3KR12 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3KR12 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3KR12 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3KR12 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3KR12 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3KR12 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3KR12 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3KR12 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3KR12 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3KR12 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3KR12 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3KR12 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3KR12 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3KR12 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3KR12 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3KR12 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3KR12 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3KR12 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3KR12 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3KR12 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3KR12 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3KR12 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
J3KR12 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3KR12 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3KR12 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3KR12 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3KR12 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3KR12 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3KR12 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3KR12 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3KR12 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3KR12 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3KR12 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3KR12 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
J3KR12 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
J3KR12 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
J3KR12 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
J3KR12 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
J3KR12 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
J3KR12 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
J3KR12 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3KR12 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3KR12 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms