Protein–RNA interactions for Protein: C9JI98

TMEM238, Transmembrane protein 238, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM238C9JI98 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM238C9JI98 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM238C9JI98 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms