Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00587B1AMM8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00587B1AMM8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms