Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NOTOA8MTQ0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms