Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NNZ2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NNZ2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NNZ2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NNZ2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NNZ2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NNZ2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NNZ2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NNZ2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NNZ2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NNZ2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NNZ2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NNZ2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NNZ2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NNZ2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NNZ2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NNZ2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NNZ2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NNZ2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NNZ2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NNZ2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NNZ2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NNZ2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NNZ2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NNZ2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NNZ2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NNZ2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NNZ2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NNZ2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NNZ2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NNZ2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NNZ2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NNZ2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NNZ2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NNZ2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NNZ2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NNZ2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NNZ2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NNZ2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NNZ2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NNZ2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NNZ2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NNZ2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NNZ2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NNZ2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NNZ2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
A6NNZ2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NNZ2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NNZ2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NNZ2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NNZ2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NNZ2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NNZ2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NNZ2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NNZ2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NNZ2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NNZ2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NNZ2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NNZ2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NNZ2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NNZ2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NNZ2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NNZ2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NNZ2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NNZ2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NNZ2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NNZ2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NNZ2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NNZ2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NNZ2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NNZ2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NNZ2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NNZ2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NNZ2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NNZ2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NNZ2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NNZ2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NNZ2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NNZ2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NNZ2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NNZ2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NNZ2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NNZ2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NNZ2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NNZ2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NNZ2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NNZ2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NNZ2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NNZ2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NNZ2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NNZ2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NNZ2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NNZ2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NNZ2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NNZ2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NNZ2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NNZ2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NNZ2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NNZ2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NNZ2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms