Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDR42E2A6NKP2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR42E2A6NKP2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms