Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GMNCA6NCL1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms