Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LAMB4A4D0S4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMB4A4D0S4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms