Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 XIRP1-202ENST00000396251 6040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 ASPH-208ENST00000517856 6337 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 EIF4B-203ENST00000420463 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SCFD2-202ENST00000401642 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 FGF11-203ENST00000575082 2315 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 DNAH2-203ENST00000572933 14955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AK4-201ENST00000327299 6836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 LAMB3-203ENST00000391911 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 ANP32E-208ENST00000583931 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 CLUHP3-201ENST00000254109 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 GIT2-203ENST00000355312 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 CYP4A11-202ENST00000371904 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 OLAH-201ENST00000378217 1767 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 LIPG-202ENST00000427224 1760 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 CEP89-201ENST00000305768 5678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC026336.3-201ENST00000611525 2076 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 ODF2-201ENST00000351030 3899 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 MERTK-207ENST00000616902 3104 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AP1S2-202ENST00000380291 3492 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 OR7E111P-201ENST00000442229 1014 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 CDRT15P2-201ENST00000447470 416 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 ZNF576-204ENST00000528387 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 KRT18P18-201ENST00000565278 1279 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 MYO18A-202ENST00000527372 9992 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 PPM1A-202ENST00000325658 4125 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SEMA4D-211ENST00000438547 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 ADIPOR2-201ENST00000357103 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 HLCS-202ENST00000399120 6466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SLC5A9-201ENST00000236495 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 PPP1CC-204ENST00000546933 2154 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 KIAA0513-206ENST00000566428 7772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 DCLK3-203ENST00000636136 5446 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 NUTM1-201ENST00000333756 3795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 RIPOR1-201ENST00000042381 4051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 WNT3-201ENST00000225512 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 ACVR2A-202ENST00000404590 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AR-203ENST00000396044 10221 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 TMEM164-201ENST00000288381 5452 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 LINC00909-202ENST00000580048 3463 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC087762.2-201ENST00000639346 3773 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 ZNF221-201ENST00000251269 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 PBX1-203ENST00000420696 6636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SRSF7-201ENST00000313117 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 PITX2-212ENST00000614423 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 PCDHB12-201ENST00000239450 3853 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 PDYN-202ENST00000539905 2725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 EYA4-208ENST00000452339 2411 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 OR2T32P-201ENST00000403423 963 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AQP7P1-201ENST00000412626 1045 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 ACTG1P12-201ENST00000423183 1166 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AL355472.3-201ENST00000425104 410 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 FLNC-AS1-201ENST00000469965 559 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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