Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 SH3YL1-204ENST00000403658 1279 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 AL078621.2-201ENST00000419351 698 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 KRTAP9-10P-201ENST00000435672 207 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 LINC01366-201ENST00000436248 983 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 AL135929.2-201ENST00000445687 505 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 IQCF5-201ENST00000446461 512 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 COL18A1-AS2-201ENST00000446475 552 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 NT5CP1-201ENST00000554092 509 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 RNF43-203ENST00000577716 4367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 AC010729.1-201ENST00000413960 1746 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 ZNF879-201ENST00000444149 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 ICOSLG-204ENST00000407780 7080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 EAF1-201ENST00000396842 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 ZBTB44-205ENST00000525842 9315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 WRNIP1-201ENST00000380764 1557 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 AC015920.1-201ENST00000624645 2450 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 ABCG1-206ENST00000398457 3119 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 ACSBG2-210ENST00000591403 2690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 NGRN-202ENST00000379095 7237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 CCRL2-202ENST00000399036 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RORCP51449 SMYD1-201ENST00000419482 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 MAP2K6-206ENST00000590474 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 PDPN-210ENST00000513143 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 SIDT2-220ENST00000628876 2609 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 ILK-202ENST00000396751 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 WHRN-204ENST00000374059 3278 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 WDPCP-201ENST00000272321 3392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 EPC1-201ENST00000263062 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 PTGS1-206ENST00000614910 4894 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 ARMC8-223ENST00000538260 4728 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 USF1-203ENST00000368021 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 AC011337.1-201ENST00000606930 3317 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 ACTR8-201ENST00000335754 3629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 KPNA3-201ENST00000261667 4474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 C10orf71-AS1-201ENST00000437677 753 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 AL354733.3-201ENST00000448389 390 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 AC069181.1-201ENST00000498256 554 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 AL132709.1-205ENST00000556136 551 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 EIF5B-205ENST00000617677 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 FP671120.4-201ENST00000629969 923 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 RPL28-201ENST00000344063 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 TECPR2-201ENST00000359520 8686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 FGD5P1-201ENST00000611158 3374 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 CTAGE16P-201ENST00000435601 2412 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 CHI3L2-202ENST00000369748 1468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 FAXC-201ENST00000389677 11508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 LINC02473-201ENST00000569621 2195 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 MON2-214ENST00000641654 10382 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 PKNOX1-201ENST00000291547 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RORCP51449 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RORCP51449 WDR91-201ENST00000354475 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RORCP51449 TNS1-221ENST00000615025 6488 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RORCP51449 ALK-207ENST00000642122 2513 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RORCP51449 ARMC2-203ENST00000392644 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RORCP51449 ATP9B-201ENST00000307671 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RORCP51449 SOGA1-202ENST00000279034 3703 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms