Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 SDAD1P1-201ENST00000519902 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 TSN-202ENST00000409193 1436 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AC024614.4-201ENST00000637454 2396 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 SLC4A5-202ENST00000358683 3142 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AC110615.1-201ENST00000438151 1955 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 NFE2L1-203ENST00000362042 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 ENPP2-203ENST00000427067 3271 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 ATP8B5P-204ENST00000439972 2522 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 PKM-202ENST00000335181 2318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 ESPNL-203ENST00000409506 3610 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 ACOX3-201ENST00000356406 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 SEPT4-204ENST00000412945 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AC007610.4-201ENST00000623307 2125 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AL139424.2-202ENST00000641335 1369 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AP000533.2-201ENST00000417863 2260 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 BCAS3-222ENST00000589222 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 TCN2-203ENST00000407817 1870 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 GBE1-201ENST00000429644 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 DSCR3-201ENST00000309117 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AL078604.2-201ENST00000430078 2002 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 LINC00880-201ENST00000471357 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 TIRAP-202ENST00000392679 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 PAX5-205ENST00000377853 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 CDK5-201ENST00000297518 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 TPM3P7-201ENST00000338274 732 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 MS4A13-202ENST00000378186 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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PTPRJQ12913 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 MTND6P14-201ENST00000433044 522 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 TMX3-202ENST00000443099 913 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 LINC02106-202ENST00000513880 225 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 OR13C2-201ENST00000542196 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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PTPRJQ12913 AC005740.4-201ENST00000607378 957 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AC137834.2-201ENST00000617433 701 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
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PTPRJQ12913 FP236383.3-201ENST00000627981 923 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 FP671120.3-201ENST00000631211 923 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 SLC43A3-202ENST00000395123 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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PTPRJQ12913 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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PTPRJQ12913 SEPT3-202ENST00000396425 4649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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PTPRJQ12913 UGGT2-203ENST00000376747 4832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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PTPRJQ12913 C1GALT1-205ENST00000436587 6235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 PKP2-202ENST00000340811 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 RBP1-201ENST00000232219 898 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 MFAP4-201ENST00000299610 1873 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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PTPRJQ12913 CFAP58-201ENST00000369703 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 RBM3-203ENST00000376759 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 LINC00443-201ENST00000421601 1170 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 APOBEC3H-204ENST00000442487 988 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 Z93242.2-201ENST00000445666 394 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 MYLK-AS1-203ENST00000485162 587 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AC034229.1-201ENST00000506299 943 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 PAX5-209ENST00000520154 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 FAU-206ENST00000529259 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 EGLN3-209ENST00000553215 1004 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 CCDC32-204ENST00000558750 814 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AC066612.1-203ENST00000560623 481 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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