Protein–RNA interactions for Protein: U3KQK5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQK5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQK5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQK5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQK5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQK5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQK5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQK5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQK5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQK5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQK5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQK5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQK5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQK5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQK5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
U3KQK5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
U3KQK5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQK5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQK5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQK5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQK5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQK5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQK5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQK5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQK5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQK5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQK5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQK5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQK5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQK5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQK5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQK5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQK5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQK5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQK5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQK5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQK5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
U3KQK5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
U3KQK5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
U3KQK5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
U3KQK5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
U3KQK5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
U3KQK5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
U3KQK5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
U3KQK5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
U3KQK5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
U3KQK5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
U3KQK5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
U3KQK5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
U3KQK5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
U3KQK5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
U3KQK5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
U3KQK5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
U3KQK5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQK5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQK5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQK5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQK5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQK5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQK5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQK5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQK5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQK5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQK5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQK5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQK5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQK5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQK5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQK5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQK5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQK5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQK5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQK5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQK5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQK5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQK5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U3KQK5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQK5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQK5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQK5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQK5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQK5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQK5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQK5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQK5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQK5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQK5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQK5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
U3KQK5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQK5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQK5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQK5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQK5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQK5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQK5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQK5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQK5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQK5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQK5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQK5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
U3KQK5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms