Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
U3KQ87 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
U3KQ87 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
U3KQ87 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
U3KQ87 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQ87 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQ87 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQ87 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQ87 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQ87 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQ87 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQ87 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQ87 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQ87 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQ87 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQ87 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQ87 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQ87 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQ87 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQ87 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U3KQ87 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U3KQ87 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U3KQ87 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U3KQ87 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U3KQ87 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U3KQ87 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U3KQ87 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U3KQ87 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
U3KQ87 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
U3KQ87 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQ87 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQ87 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQ87 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQ87 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQ87 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQ87 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQ87 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQ87 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQ87 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQ87 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQ87 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQ87 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQ87 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQ87 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQ87 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQ87 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQ87 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQ87 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQ87 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQ87 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQ87 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQ87 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQ87 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQ87 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQ87 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQ87 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQ87 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQ87 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQ87 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQ87 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQ87 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQ87 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQ87 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQ87 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQ87 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQ87 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQ87 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQ87 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQ87 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQ87 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQ87 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQ87 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQ87 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQ87 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQ87 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQ87 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQ87 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQ87 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQ87 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQ87 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQ87 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQ87 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQ87 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQ87 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQ87 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQ87 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQ87 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQ87 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQ87 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
U3KQ87 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U3KQ87 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
U3KQ87 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U3KQ87 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U3KQ87 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
U3KQ87 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
U3KQ87 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
U3KQ87 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
U3KQ87 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
U3KQ87 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U3KQ87 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms