Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms