Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDY1Q9Y6F8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms