Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AUP1Q9Y679 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AUP1Q9Y679 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms