Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX10Q9Y5X0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms