Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX13Q9Y5W8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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SNX13Q9Y5W8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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SNX13Q9Y5W8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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SNX13Q9Y5W8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX13Q9Y5W8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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