Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms