Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y547

HSPB11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB11Q9Y547 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB11Q9Y547 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSPB11Q9Y547 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms