Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y512

SAMM50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMM50Q9Y512 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAMM50Q9Y512 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMM50Q9Y512 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms