Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC36.42■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
RAD54L2Q9Y4B4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC36.32■■■■□ 3.41
RAD54L2Q9Y4B4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
RAD54L2Q9Y4B4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RAD54L2Q9Y4B4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RAD54L2Q9Y4B4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RAD54L2Q9Y4B4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RAD54L2Q9Y4B4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
RAD54L2Q9Y4B4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RAD54L2Q9Y4B4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
RAD54L2Q9Y4B4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
RAD54L2Q9Y4B4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RAD54L2Q9Y4B4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RAD54L2Q9Y4B4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RAD54L2Q9Y4B4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
RAD54L2Q9Y4B4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RAD54L2Q9Y4B4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
RAD54L2Q9Y4B4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RAD54L2Q9Y4B4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
RAD54L2Q9Y4B4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RAD54L2Q9Y4B4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
RAD54L2Q9Y4B4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
RAD54L2Q9Y4B4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
RAD54L2Q9Y4B4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms