Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms