Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HDGFL3Q9Y3E1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HDGFL3Q9Y3E1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms