Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms