Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.79■■■■■ 5.72
NISCHQ9Y2I1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC50.79■■■■■ 5.72
NISCHQ9Y2I1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC50.79■■■■■ 5.72
NISCHQ9Y2I1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC50.79■■■■■ 5.72
NISCHQ9Y2I1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC50.79■■■■■ 5.72
NISCHQ9Y2I1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC50.79■■■■■ 5.72
NISCHQ9Y2I1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC50.79■■■■■ 5.72
NISCHQ9Y2I1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC50.79■■■■■ 5.72
NISCHQ9Y2I1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.78■■■■■ 5.72
NISCHQ9Y2I1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC50.78■■■■■ 5.72
NISCHQ9Y2I1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC50.78■■■■■ 5.72
NISCHQ9Y2I1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC50.78■■■■■ 5.72
NISCHQ9Y2I1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.77■■■■■ 5.72
NISCHQ9Y2I1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.77■■■■■ 5.72
NISCHQ9Y2I1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.77■■■■■ 5.72
NISCHQ9Y2I1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC50.76■■■■■ 5.72
NISCHQ9Y2I1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.76■■■■■ 5.72
NISCHQ9Y2I1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC50.76■■■■■ 5.72
NISCHQ9Y2I1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.76■■■■■ 5.72
NISCHQ9Y2I1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50.75■■■■■ 5.72
NISCHQ9Y2I1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC50.75■■■■■ 5.72
NISCHQ9Y2I1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.75■■■■■ 5.72
NISCHQ9Y2I1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.75■■■■■ 5.72
NISCHQ9Y2I1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.75■■■■■ 5.72
NISCHQ9Y2I1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC50.75■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.75■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.75■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC50.75■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC50.75■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC50.75■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC50.75■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC50.75■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC50.75■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.75■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC50.74■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.74■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC50.74■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC50.74■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.73■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.73■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC50.73■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.73■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.73■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.72■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC50.72■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC50.72■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.72■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC50.72■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC50.72■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC50.72■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.71■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.71■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.71■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC50.71■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC50.71■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.71■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC50.71■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC50.7■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.7■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.69■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC50.69■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC50.69■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC50.69■■■■■ 5.71
NISCHQ9Y2I1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.68■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC50.68■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC50.68■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.68■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC50.68■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.68■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC50.68■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC50.68■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.68■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC50.67■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC50.67■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC50.67■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC50.67■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.67■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC50.67■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC50.67■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC50.67■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.66■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC50.66■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC50.66■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.66■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC50.66■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC50.66■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.66■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC50.66■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC50.66■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC50.66■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.65■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC50.65■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.64■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC50.64■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC50.64■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC50.64■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.64■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.63■■■■■ 5.7
NISCHQ9Y2I1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC50.62■■■■■ 5.69
NISCHQ9Y2I1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC50.62■■■■■ 5.69
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