Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC4Q9Y296 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms