Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POMPQ9Y244 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POMPQ9Y244 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms