Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNQ9UQP3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNNQ9UQP3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms