Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
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