Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FZD4Q9ULV1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms